根治扁平疣，患者可外用抗病毒药和角质剥脱剂，密集多发的扁平疣需应用免疫调节剂，也可采取物理疗法。

扁平疣是人乳头瘤病毒感染引发的，会在皮肤表面形成扁平的褐色丘疹，患者可外用抗病毒的药物和角质剥脱剂进行治疗，如水杨酸软膏、阿达帕林凝胶等，应用这些药物可以减少病毒复制，并能促进疣体脱落。如果是密集多发的扁平疣，还需在医生的指导下应用免疫调节剂，如卡介菌多糖核酸注射液、注射用胸腺五肽、盐酸左旋咪唑搽剂等，这些药物能够提高免疫力，促进病情好转的同时也可以降低复发率。部分扁平疣需在医生的指导下采取物理疗法进行治疗，如液氮冷冻该方法是利用液氮的低温使疣体坏死和脱落。也可在医生的指导下选择激光治疗，利用激光的热度将疣体灼烧破坏，达到清除的目的。这些物理方法能清除疣体，但也有可能会留下疤痕，需谨慎选择。患者的治疗需要在医生的指导下进行，以免出现不良反应。