埋线双眼皮的后遗症有上睑凹陷，下睑外翻，睁眼乏力，眼球出血，皮下组织淤血肿胀等，不过这些后遗症也并不一定会发生，因为这些主要是手术过程中操作不当所引起的，所以选择正规的医院进行手术就可避免。
埋线双眼皮后遗症可能会导致局部皮肤出现囊肿的形成，也有可能会出现疤痕增生的形成，同时不排除神经损伤导致神经麻木或者感知功能下降的可能。埋线双眼皮后遗症一般表现为手术不会出现增生现象，也可能会出现双侧不对称的现象发生。出现后遗症大都是由于术后护理工作不当所导致，也可能是由于医生不够专业手术操作不当所引起的。
由于个人的体质不同，医生的专业水准程度不同，所产生的损害程度不同，表现出的后遗症也会存在偏差。需要到正规整形机构，配合经验比较丰富的医师进行规范的操作，能够降低埋线双眼皮出现后遗症的可能性。