乙脑的临床表现可以分为四期，初期，急期，恢复期和后遗症期。

一，初期。病出一到三天，起病急，体温在一到两天内上升至三十到四十摄氏度伴有头痛，精神倦怠，食欲差，恶心，呕吐和嗜睡，此期很容易误诊为上呼吸道感染。

二，急期。病程三到十天，此期患者除了全身毒血症状加重外，突出表现为脑损害症状明显，有高热意识障碍，惊厥或抽搐，脑水肿及颅内压增高，呼吸衰竭。其它神经系统体征，及循环衰竭，其中高热抽搐和呼吸衰竭是乙脑急期的严重表现。

三，恢复期。患者体温逐渐下降及恢复正常，神经系统症状和体征逐渐好转，一般患者于两周左右可以完全康复，但重型患者需要一到六个月才能逐渐恢复。

四，后遗症期。后遗症与乙脑病变轻重有密切的关系，后遗症主要有意识障碍，痴呆，失语，肢体瘫痪等，如果给予积极的治疗，也可有不同程度的恢复。