连花清瘟胶囊如果应用于适应症范围内的疾病，它一般是有效的，例如风热型的感冒服用连花清瘟胶囊可以明显减轻发热、咳嗽等症状；但是对于其他非适应症范围的疾病，例如风寒型感冒，则一般没有效果或者疗效差。
连花清瘟胶囊的主要有效成分包括连翘、麻黄、生石膏、贯众、板蓝根、鱼腥草、广藿香、大黄、甘草、薄荷、红景天等，一般具有清瘟排毒、宣肺清热等功效，临床上主要用于风热侵袭肺脏所引起的流行性感冒的治疗。
对于风热型感冒所引起的发热、恶寒、咳嗽咽痛、肌肉酸痛、鼻塞流涕、头痛、苔黄或者是黄腻等症状，一般能缓解症状。但是临床应用连花清瘟胶囊应该注意，这种药物不适宜长期服用，因为服药后有可能导致胃肠黏膜的刺激，引起患者消化不良等症状表现。