引起肛瘘的原因有以下几点：

一、饮食因素，比如平时比较爱吃辛辣、油腻这些刺激性的事物，而且平时大量饮酒，大量吸烟，吃生辣椒、生蒜比较多。

二、免疫力低下，如果长期熬夜，休息不规律或者长途劳顿、出差、免疫力低下时候，会导致局部感染，形成肛瘘。

三、解剖因素，肛瘘90%以上的是由于肛窦感染所导致，肛瘘又叫做肛管直肠瘘，它是肛管与直肠与肛门皮肤相通的一种异常管道。

如果按照病原体分类，可以分为化脓性、结核性、梅毒性，如果化脓性是非特异性肛瘘，而结核性或者梅毒性的肛瘘属于特异性的肛瘘。肛瘘大多继发生于肛周脓肿，自行破溃，或者是通过手术切开排脓以后，形成的一种异常的管道，肛瘘最根本的治疗方法是手术切开引流。