麝香的主要功效是开窍醒神、活血通经、消肿止痛。麝香可以开窍通闭、辟秽化浊，是醒神回苏的要药，可用于治疗各种原因导致的闭证神昏，不论是寒闭、热闭，使用皆有很好的效果。而且麝香有良好的活血散结、消肿止痛的作用，可用于治疗疮疡肿毒，瘰疬痰核，咽喉肿痛。

另外麝香可以活血化瘀、止痛，临床常用于治疗血瘀经闭，癥瘕，心腹暴痛，头痛，跌打损伤，风寒湿痹。此外麝香活血通经，辛香走窜，效力可以达胞宫，有催生下胎的效果，也可以用来治疗难产，死胎。