肚子是指腹泻。三个月婴儿腹泻可能是因为胃肠道功能紊乱、肠道菌群失调症、急性胃肠炎等原因导致，可通过物理方法、口服药物等方式治疗。

1、胃肠道功能紊乱：

三个月的婴儿胃肠道功能较差，如果腹部受凉或者家长喂养不当，则会导致胃肠道的正常功能受到影响，从而引起腹泻、腹胀、呕吐等症状。家长可使用热水袋给婴儿腹部热敷，可促进局部血液循环改善症状。必要时也可遵医嘱服用婴儿健脾散、醒脾养儿颗粒、小儿七星茶颗粒等药物治疗。

2、肠道菌群失调症：

三个月婴儿身体的免疫功能较差，此时会导致肠道内的有益菌数量减少，并使有害菌大量滋生，从而对肠道黏膜造成刺激，引起腹泻、腹痛等症状，同时伴有发热、呕吐等。可遵医嘱服用双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒、地衣芽孢杆菌活菌颗粒等益生菌药物治疗，可调理肠道菌群，缓解症状。

3、急性胃肠炎：

若婴儿受到轮状病毒、诺如病毒等病毒感染，会导致胃肠道黏膜受到刺激，从而形成炎症性损害，主要表现为水样大便、腹泻、呕吐、发热等。可遵医嘱服用蒙脱石散、双歧杆菌三联活菌散、地衣芽孢杆菌活菌颗粒等药物治疗，可有效的改善症状。

除以上相对常见原因外，还有其他的可能性疾病，比如乳糖不难受、胃肠型感冒、过敏等，应前往医院完善检查，对因治疗。