精子发黄的原因主要有：生殖道炎症，若有正常性生活，而精液持续发黄表明生殖道内有炎症，很有可能是前列腺炎、精囊炎，如不及时治疗会影响精液的质量，甚至引起不育禁欲时间长。

精液的颜色是由组成精液的成分决定的，精液由精子和精浆组成，精子量只占极少部分90%以上为精浆。精浆是由前列腺精囊，尿道球腺、尿道旁腺等附属性腺分泌的，主要成分是水，还有脂肪、蛋白质颗粒、色素颗粒、卵磷脂小体、酶类、果糖等五种成分。

正常人的精液是灰白色或稍带土黄色，如果禁欲时间长，由于理化性的改变颜色会黄一些，这都是正常的。精子畸形症可能也是精液发黄的原因之一，精液中畸形精子超过20%，畸形精子包括头、尾、体形态异常或头体混合畸形。