新冠疫苗第三针有一些禁忌症的人群，是不能够注射的，主要有对新冠疫苗的成分，有过敏的患者，以及曾经接种过新冠疫苗出现过过敏的患者，还有急性病以及慢性病急性发作，或者是有严重的慢性病并没有恢复，处于活动期。

此外还包括发热，以及中枢神经系统疾病，这些都是禁忌症。此外还有正在怀孕的、妊娠期的妇女，也是不能够注射第三针新冠疫苗的。