上腭有两个小孔是腭小凹或腭大孔，腭小凹位于软腭前端中线两侧的黏膜凹陷处，是硬腭后缘鼻后棘的表面解剖标志。软腭占腭的后1/3且附着于硬腭后缘，向后延伸，软腭后缘游离，斜向后下称为腭帆。在软腭的口腔面及邻近部位可见具有临床意义的表面解剖标志，其中腭小凹就是典型的表面解剖标志。

除腭小凹外，腭大孔位于上额软腭与硬腭区的交界处，位于上颌第三磨牙腭侧龈缘至腭中线弓型凹面连线的中点。位于腭小后段的腭垂也叫悬雍垂，参与重要的发音功能，还具有相关的免疫功能。

日常生活中需避免进食过硬、过烫，以及过于辛辣、刺激的食物，以免损伤腭小凹或腭大孔部位的黏膜，造成黏膜破损。容易导致继发感染或形成局部溃疡，出现局部红肿、疼痛，以及破溃等症状。