小哇健康说

健康生活,从日常做起
1/3

菌落(液)PCR原理+详细操作
1、PCR原理:利用双链DNA的半保留复制,高温变性解旋成单链以及低温复性成双链、碱基互补配对原则,通过温度变化控制DNA的变性和复性,加入设计引物,耐热DNA聚合酶-Taq酶(该酶可以耐受90℃以上的高温而不失活)、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。
2、菌落PCR(Colony PCR):基本原理与PCR一样。常规PCR扩增需要进行细菌培养、质粒制备等多步操作后才能进行基因扩增,操作繁琐,耗时,同时在反复的操作中DNA量损失也较大,产率较低。菌落PCR不同在于,直接以单个菌作为模板。是一种可以快速鉴定菌落是否为含目的质粒的阳性菌落。操作简单,快捷,阳性率较高,在转化鉴定中较常见。
一、菌落PCR筛选基本步骤:
1. 单菌落挑取(挑过的菌记得在培养皿外做标记)
2. 菌落PCR反应(冰上PCR溶液体系配置,PCR仪器设置)
3. DNA电泳检测
4. 判断阳性克隆并测序(注意保种)
二、菌落PCR具体操作:
拿到长斑的板子,在超净工作台挑斑;
准备6个1.5ml的管子,标记好顺序,加50uL有抗性的液体培养基;
准备个pcr管,对应的写好顺序标签,加9ul无菌水;
用枪头轻轻点在斑上,在pcr管子里吹吸混匀,在往相应编号的离心管中搅一搅,培养;
添加pcr反应液11ul至每一PCR管(管子里一共20ul),加热并离心,增加对细胞膜破坏;
6管+1管含目的基因质粒+1管不含质粒,全部一起做PCR;
pcr跑完后跑核酸胶,有正确条带的为阳性克隆,并取相应序号的菌液转接培养,抽取质粒并送公司测序。
注意:PCR产物的电泳检测时间一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚至消失。
三、菌液PCR具体操作:
拿到长斑的板子,在超净工作台挑斑;
准备6个1.5ml的离心管,标记好顺序,加50uL有抗性的液体培养基;
用枪头轻轻点在斑上,离心管中搅一搅,培养;
准备8个pcr管,对应的写好顺序标签,添加pcr反应液和菌液(6管),和对照组(2管)一起进行PCR。
跑核酸胶电泳,转接培养,抽取质粒并送公司测序。
两种方法均可以选择,如果不赶时间,求简便可以选择菌液PCR,如果赶时间,来不及当天送测序了,可以选择第菌落PCR。
四、电泳条带结果分析~在下一篇笔记

2023-11-10 22:46
交流一下
抢沙发