排异反应是异体组织进入有免疫活性宿主的不可避免的结果，这是一免疫过程。根据临床及生物学特点慢性排斥反应的发病机理目前尚不明了，主要困难在于：(1)慢性排斥反应从病理表现上不易与长期药物治疗所造成的血管病变相区别;(2)针对慢性排斥的药物学研究几乎处于空白状态;(3)缺乏理想的研究慢性排斥反应的动物模型。

　　关于慢性排斥反应的新概念：(1)慢性排斥反应由多种病理因素所造成，因而并非单一免疫抑制治疗所能克服。(2)非免疫因素，如缺血、再灌注所造成的损伤、手术所造成的损伤等对移植物存活有着长远的影响，这些因素对免疫抑制治疗、免疫耐受的诱导亦有着不可忽视的阻碍作用。(3)早期频繁发生的急性排斥所造成的组织损伤亦可成为晚期移植物功能丧失的病理学基础。因此，慢性排斥反应更确切地说应为晚期移植物功能丧失。由此可见，减少晚期移植物功能丧失，可以采取预防为主的方针，如尽量减少缺血和再灌注损伤、减少手术损伤、有效控制急性排斥反应等。