事实上，乙肝病毒对肝细胞的破坏，却并不存在这种数量关系。其主要原因就是乙肝病毒并不直接造成肝细胞的破坏，免疫系统对受感染肝细胞的攻击才是造成肝细胞损伤的主要原因。人体的免疫系统是一个统一的整体，对于外来的抗原十分敏感，少量的病毒抗原就足以调动起全身的免疫反应，所以病毒数量的增减与免疫反应的强弱关系并不大。其实免疫反应的强弱更多的是受自身的调节。例如人的T淋巴细胞中有一种亚型，称为T辅助细胞，可以增强免疫反应。还有一种亚型称为T抑制细胞，可以抑制免疫反应。辅助性T细胞和抑制性T细胞的比例就起着调节免疫反应强弱的作用。淋巴细胞还可以释放许多淋巴因子，也能够调节免疫反应。

许多实验资料表明，血清中HBVDNA的数量（反映血清中的病毒颗粒数量）与反映肝损害严重程度的转氨酶（ALT、AST）无平行关系，二者无统计学上的相关性。肝活检的组织学检查也表明，肝细胞的坏死程度，肝纤维化的程度与血清中HBVDNA定量水平也没有相关性。在临床上，我们也观察到很多患者体内携带有大量的乙肝病毒，HBVDNA强阳性，HBeAg阳性，HBsAg滴度也非常高，但肝功能却长期正常，肝组织学也没有明显纤维化的迹象。而很多肝硬化患者常常表现为HBeAg~阴性，HBVDNA阴性，病毒数量很少，但肝脏病变却已达晚期。这些不争的事实也说明了病毒数量的多少与肝损害的程度并无相关关系，并非病毒多了，肝损害就一定很严重。