毛囊炎流脓首先要手术清创，然后在配合使用药物治疗，以防止感染。

1、手术清创：毛囊炎挤出脓后若伴随疼痛，或感染加重，甚至局部产生脓包，应在医生指导下做局部清创处理，如切开引流，放出脓液。

2、药物治疗：在切开引流后，可以遵医嘱使用碘伏、碘酊、医用酒精等进行清洁、消毒，并在医生指导下局部涂抹莫匹罗星软膏、夫西地酸钠软膏、克林霉素磷酸酯凝胶等，以起到消毒、杀菌、预防感染的作用。

注意：若患者毛囊炎感染严重，比如出现全身性炎症反应，如发烧等，可口服头孢呋辛酯片或胶囊、盐酸多西环素片、阿奇霉素片等抗感染药物治疗。