条件反射神经中枢的位置是大脑皮层。

条件反射是巴甫洛夫提出的高级神经活动学说内容之一，是指人在后天生活、学习、与人交往过程中逐渐形成的后天性反射，如“望梅止渴、画饼充饥”等，是在大脑皮层参与下完成的高级神经活动，所以受参与条件反射的神经中枢位于大脑皮层，并受到大脑的控制。

与条件反射相对应的是非条件反射，这是先天形成的，不需要经过后天的学习，也不需要大脑记忆中枢参与的反射，属于生物在进化中形成的本能反射，主要包括缩手反射、膝跳反射、眨眼反射、排尿反射等，受到位于大脑皮层以下的低级神经中枢控制。