细菌性痢疾一般是发生于细菌性痢疾的流行季节，患者有腹痛，腹泻，脓样便，急性期病人会有发热而且多出现消化道症状之前，慢性期病人的过去发作史比较重要，大便图片镜检以及细菌培养有助于诊断的确立，乙状结肠镜检查以及x线检查对鉴别慢性细菌性痢疾以及其他肠道疾病有一定价值，在细菌性痢疾的流行季节，凡是突然的发热，惊厥而没有其他症状的患儿要考虑到中毒性细菌性痢疾的可能性。

阿米巴痢疾一般情况下起病比较缓慢，很少有毒血症症状里急后重感比较轻，大便次数也少，腹痛多在右侧，典型者粪便呈果酱样有腐臭，镜检会发现仅有少许的白细胞，红细胞凝集成团可以找到阿米巴滋养体，乙状结肠镜检查一般情况下肠粘膜而大多是正常的，可能会有散在的溃疡，该病容易并发肝脓肿也是阿米巴痢疾的有特点。