巧克力囊肿大多数情况下没有明显的症状，只是妇科检查或者是B超检查时被发现。

较大的巧克力囊肿可以出现频繁的破裂，囊液流入盆腔，在盆腔受炎症刺激后形成粘连，包括卵巢组织会导致卵巢的激素分泌、卵子的排出出现异常，进而影响女性的月经以及女性的受孕。

当发现卵巢的巧克力囊肿时，需要及时的进行手术治疗，切除病灶以后，复发率仍然较高，还需要通过药物治疗的方式预防复发。如果有受孕的需求可在进行手术和药物治疗以后，尽快的安排受孕。