治疗脑血栓，主要包括静脉溶栓、血管内治疗、抗血小板药、脑保护药以及活血化瘀的中成药。

静脉溶栓是治疗脑血栓的首选手段。如果患者在起病后3~4.5小时内就诊，则有可能接受静脉溶栓治疗。静脉溶栓能够使30%的脑血栓患者重新恢复正常的神经功能。此外，血管内治疗也是治疗脑血栓非常重要的手段，血管内治疗尤其适用于大血管病变的患者。而对于脑血栓的恢复期，主要是采取康复治疗的手段以及二级预防。二级预防主要包括控制血压、血糖、血脂等高危因素。而康复治疗则可以使有后遗症的患者最大可能的恢复正常的神经功能，从而回归社会和家庭。