卵巢早衰的治疗主要以激素补充治疗为主。

激素补充主要通过雌激素类的药物，可以缓解因雌激素水平低而引起的症状，而且对心脑血管疾病和骨质疏松可以起到预防作用。

但雌激素的使用要了解有无雌激素使用的禁忌症，例如有血栓或者有乳腺癌的患者，是不宜进行雌激素补充的。对于卵巢早衰时有生育要求的女性，可以进行辅助生殖技术的治疗，而达到受孕的目的。卵巢早衰使用药物治疗可以缓解其症状，延缓卵巢早衰的进程，但卵巢功能的逐渐衰退无法根本性的扭转。