肛瘘术后的护理主要就是以保持肛门局部的清洁为主，特别是在排过大便之后，一般会推荐患者使用稀释的高锰酸钾溶液进行泡洗、坐浴，也可以使用一些中药成分的制剂进行泡洗坐浴，比较常用的有复方荆芥熏洗剂、苦参洗剂、五倍子洗剂等药物。

肛瘘在手术之后还要注意多休息，尤其是避免疲劳、熬夜的发生，注意勤换洗内衣裤，尽量的保持肛门局部的干燥透气。另外在术后也要注意调整饮食结构，可以适当的增加膳食纤维含量高的水果和蔬菜，主要的目的就是避免发生大便的干燥，减少粪便对手术伤口的影响。