自体组织乳房的优点更加自然，更接近于对侧乳房的形状，比如有一定的下垂度，随着年龄的增长也会有一定的下垂松软等等，手感上也更好一些。

但是它的缺点也有比较明显，首先是供区的采集，比如说要用背阔肌肌瓣，在后背的这个部位会留下一个伤口，会取一部分的背阔肌的肌肉组织，这个会引起供区的损伤，对于需要利用上肢活动的运动员和进行体力劳动的人来说，这个都是不合适的，会影响以后的生活。

如果取腹直肌肌瓣，对于过于肥胖的患者更好一些，但是对于没有生过孩子的和常要进行体力活动，还有进行体育锻炼的来讲，腹直肌的缺失会对患者的肌肉收缩和功能产生一部分影响，会影响患者的将来生活。

另外，取自体组织的所有部位，也就是叫供区。有可能出现一些的血肿，组织不愈合、感染、组织坏死等等的一些合并症。