制何首乌具有一定的毒副作用，其毒副作用主要是因为何首乌含有毒性成分蒽醌类，如果长期过量服用，会对胃肠产生刺激作用，出现肠鸣、恶心、腹痛、腹泻、呕吐等症状，时间长了肯定会产生毒性，最常见的便是腹泻。

何首乌与错误的食用材料一起搭配，食用后会造成身体不适。何首乌若与其它的食物一起服用，切记不可同以下这些食品一同煎煮：葱、蒜、猪肉、无鳞鱼、铁质器，或者会出现头晕眼花等症状，重者可出现阵发性强直性痉挛、躁动不安、抽搐，甚至发生呼吸麻痹。

过量服用何首乌会对胃部会造成损害。何首乌还有类似肾上腺皮质功能的作用，可使其应激能力明显提高，何首乌对去甲肾上腺素有促进作用，可以使肝糖原明显增加。