胆汁反流性胃炎确诊主要是依靠胃镜检查和胃吸出物的测定。也可以做同位素的测定，同位素可以了解反流的程度。在胃镜检查下。可以看到胃腔内有浅黄或者黄绿色的储留液，或者是胃壁上黏附有含有胆汁的黏液或者是可以看到胃的幽门口松弛或处于一个开放固定的状态。还会有胃炎的表现，比如胃粘膜的弥漫性红色改变，黏膜出现水肿，糜烂或者是溃疡。也可以通过用胃管到达胃腔，抽吸空腹以及餐后的胃液来测量血液中的胆酸含量，如果胆酸含量较高，即可确诊为胆汁反流性胃炎。