过敏性肺炎可通过培养和血清学试验与鹦鹉热，病毒性肺炎及其他感染性肺炎鉴别。当急性发作前的典型接触史不能确定时，由于临床特点，x线及肺功能检查的相似，特发性纤维化则难与过敏性肺炎鉴别。成人细支气管炎的变异类型，如阻塞性细支气管炎伴机化性肺炎，可类似于限制性疾病，而且当无相关病史或开胸肺活检未发现典型改变时，两者难以区别。有自身免疫证据，如抗核DNA抗体，或乳胶固定实验阳性，或有胶原性血管疾病，表示为特发性或继发性普通间质性肺炎。慢性嗜酸性肺炎，常伴周围血嗜酸性粒细胞增多，支气管哮喘和变应性支气管，肺曲霉菌病，有嗜酸性粒细胞增多和阻塞性，而非限制性肺功能异常。