腹泻按病程可分为急性腹泻和慢性腹泻。急性腹泻发病比较急，病程在2～3周之内，大多系感染引起。慢性腹泻指病程在两个月以上或间歇期在2～4周内的复发的腹泻，发病原因更为复杂。

腹泻按有无病理变化可分为生理性腹泻和病理性腹泻，生理性腹泻常发生于母乳喂养的婴幼儿，通常不影响孩子的生长发育，随着年龄增大，腹泻的症状可消失。病理性腹泻则是由于多种原因引起的。

腹泻按有无病原体感染可分为感染性腹泻与非感染性腹泻。感染性腹泻的病原体包括病毒（轮状病毒、诺瓦克病毒、柯萨奇病毒、埃可等病毒）、细菌（大肠杆菌、沙门菌、志贺菌、痢疾杆菌、霍乱弧菌）或寄生虫（溶组织阿米巴原虫、梨形鞭毛虫）引起的肠道感染。非感染性腹泻包括中毒引起的腹泻，药物引起的腹泻等。