脑血栓的治疗包括急性期治疗和康复期治疗。

急性期治疗又分为一般治疗、特殊治疗和并发症的治疗。一般治疗主要包括建立静脉通路，保持呼吸道通畅，监测生命体征，给氧，对症处理等等。特殊治疗主要包括静脉溶栓、血管内治疗、脑保护治疗、神经营养治疗、抗血小板治疗以及中医中药治疗。并发症的治疗主要是针对脑血栓急性期常见的并发症的治疗，主要包括脑水肿、肺部感染、消化道出血、下肢深静脉血栓形成等等。

康复期治疗主要包括患者神经功能缺损症状的训练以及二级预防治疗。常见的康复内容主要包括认知、意识、语言、吞咽功能、肢体力量训练等。而二级预防治疗主要是针对脑血栓的高危因素给予干预，包括控制血压、血糖、血脂、体重、戒烟、戒酒等等。